Лаборатория - практическому здравоохранению

Анализ на носительство самой частой мутации в гене CFTR - дельта F508.

Анализ на носительство мутаций (C282Y, H63D и S65C) в гене HFE, ответственных за развитие гемохроматоза. Более подробная информация о заболевании и исследуемых мутациях.pdf

Анализ на носительство мутаций 2282del4, R501X и R2447X в гене филаггрина FLG, которые значительно повышают риск развития атопического дерматита. Информация о наличии у больного атопическим дерматитом этих мутаций может влиять на тактику ведения больного.

Анализ на носительство мутаций 2282del4, R501X и R2447X в гене филаггрина FLG, ответственных за развитие вульгарного ихтиоза.

Анализ на носительство двух самых частых мутаций, ответственных за развитие альфа1-антитрипсиновой недостаточности в гене AATH (PIZ, PIS). Рекомендуется тестирование при хроническом бронхите у некурящих, эмфиземе легких преимущественно в базальных отделах, рецидивирующих бронхо-легочных инфекциях (пневмонии), бронхоэктатической болезни при отсутствии других факторов риска, идиопатическом фиброзе легких, ХОБЛ в возрасте до 50 лет, циррозе печени при отсутствии явных факторов риска, хроническом панкреатите.

Анализ на носительство динуклеотидной инсерции в области ТА-повтора в промоторном районе гена UGT1А1 (6ТА/7ТА). У гетеро- и гомозиготных носителей динуклеотидной инсерции возможна манифестация болезни Жильбера с развитием токсических реакций при приеме некоторых лекарственных препаратов: парацетамол, диклофенак, ампициллин, вальпроевая кислота, циметидин, атазанавир, нилотиниб, иринотекан, пазопаниб, арформотерол, глюкокортикоиды, индакатерол, андрогены, рифампицин, этинилэстрадиол, стрептомицин, кофеин, хлорамфеникол, салицилат натрия.

Микроделеции AZF локуса Y-хромосомы, который содержит большое количество генов, ответственных за формирование сперматозоидов. Наиболее часто встречаются делеции AZFa, AZFb и AZFc (у 11 % мужчин с азооспермией и у 8 % мужчин с олигозооспермией). Исследование на наличие этих мутаций позволяет прогнозировать эффективность лечебных процедур при мужском бесплодии.

Ген TCF7L2 (rs7903146, С/T).

Анализ полиморфизма гена аполипопротеина Е (е2/е3/е4).

Секвенирование экзонов гена рецептора липопротеинов низкой плотности LDLR

Секвенирование экзонов гена GCK при MODY диабете

Анализ на наличие мутаций A2142G и A2143G в гене 23S rRNA микроорганизма Helicobacter pylori. ДНК выделяется из биоптата слизистой желудка.

Тромбофилия – заболевание системы крови, проявляющееся в нарушении гемостаза и склонности к развитию рецидивирующих сосудистых тромбозов (преимущественно венозных) различной локализации, и часто возникающее в связи с беременностью, после хирургического вмешательства, травмы или физического перенапряжения. Заболевание обусловлено генетической (у 30-50% с тромботическим состоянием) или приобретенной патологией клеток, а также дефектами свертывающей системы крови. Наследственная тромбофилия представляет собой предрасположенность к тромбозу вследствие генетических дефектов как свертывающей, так и противосвертывающей (антикоагулянтной и фибринолитической), системы крови. Генетический анализ позволяет выявить полиморфизмы генов факторов и компонентов системы гемостаза, которые приводят к их аномальному синтезу или нарушению функциональной активности. Это позволяет оценить риски развития сердечно-сосудистой патологии и акушерско-гинекологических осложнений, тромбоэмболии, венозных и артериальных тромбозов. Скрининг генетических особенностей тромбофилий помогает на раннем этапе выявить группу риска и внести соответствующие коррективы в тактику ведения пациентов.

Дополнительные факторы риска развития тромбофилических состояний:

• Приобретенные заболевания крови (тромбоцитозы, этитремия, антифосфолипидный синдром)

• Атеросклероз

• Мерцательная аритмия

• Варикозное расширении вен нижних конечностей

• Артериальная гипертензия

• Травмы и хирургические вмешательства

• Злокачественные новообразования

• Ожирение

• Беременность и послеродовый период

• Прием гормональных препаратов

• Химиотерапия

• Курение

• Гипокинезия

• Чрезмерные физические нагрузки

Показания к генетическому анализу:

• Случаи наследственной тромбоэмболии в семье

• Случаи тромбоза в анамнезе

o единичный тромбоз до 50 лет

o повторные тромбозы

o случай тромбоза в любом возрасте при наличии семейного анамнеза

o тромбозы необычной локализации (портальные, брыжеечные, мозговые вены)

o тромбоз неясной этиологии после 50 лет

• Применение гормональной контрацепции или гормональной заместительной терапии у женщин, имеющих тромбозы в анамнезе, имеющих родственников 1 степени родства с диагностированной наследственной тромбофилией или семейный анамнез тромбоэмболических осложнений

• Осложненный акушерский анамнез

• Все женщины, планирующие беременность

• Ситуации высокого риска

o массивные хирургические вмешательства

o длительная иммобилизация

• Профилактика тромботических осложнений у больных злокачественными новообразованиями

Фолиевая кислота - водорастворимый витамин B9, производными которого являются фолаты. Данная группа соединений играет ведущую роль в широком спектре жизненно важных процессов:

• Стимулирует эритропоэз

• Участвует в синтезе аминокислот (в т.ч. метионина, серина, глицина), нуклеиновых кислот, пуринов, пиримидинов, витаминов

• Участвует в обмене холина, гистидина

• Является важным сопутствующим фактором в метилировании ДНК и РНК

• Способствует регенерации мышечной ткани

• Влияет на развитие быстро растущих тканей, (кожа, оболочки желудочно-кишечного тракта, костный мозг)

• Выполняет защитную функцию при беременности по отношению к действию тератогенных и повреждающих факторов на плод

• Способствует нормальному созреванию и функционированию плаценты

• Фолиевая кислота имеет эстрогеноподобное действие, что позволяет снижать прием гормонов при заместительной гормональной терапии

Нарушение фолатного цикла приводит к накоплению гомоцистеина в клетках и повышению общего уровня гомоцистеина в плазме. Гомоцистеин обладает выраженным токсическим, атерогенным и тромбофилическим действием, что обусловливает повышенный риск развития ряда патологических процессов.

Причины нарушения фолатного цикла:

• Генетические дефекты ферментов фолатного цикла MTHFR, MTR и MTRR

• Дефицит фолиевой кислоты

• Дефицит витаминов В6 и В12

Показания к генетическому анализу:

• Повышенный уровень гомоцистеина в крови (гипергомоцистеинемия)

• Невынашивание беременности, гибель плода во 2 и 3 триместрах беременности

• Рождение ребенка с изолированными пороками нервной трубки, сердца или урогенитального тракта

• Плановая подготовка к беременности

• Наличие ИБС, артериальной гипертонии, атеросклероза или атеротромбоза

• Тромбоэмболии

• Антифосфолипидный синдром

• Семейная предрасположенность к онкологическим заболеваниям

• Назначение химиотерапии

• Назначение оральных контрацептивов и гормональной заместительной терапии

Генетические факторы наравне с клиническими являются значимыми в подборе индивидуальных доз варфарина. Клинические факторы определяют вариабельность дозы на 17-21%, генетические факторы определяют до 53-54% вариабельности дозы.

Наиболее значимые гены, определяющие индивидуальную реакцию на терапию варфарином: CYP2C9, CYP4F2, VKORC1

Цитохромы CYP2C9 и CYP4F2 – это ферменты, отвечающие за метаболизм варфарина в организме. Они принимают участие в обмене в основном S-изомера варфарина, являющегося в 5 раз более активным, чем R-изомер, и потому имеющим большее клиническое значение. Полиморфизмы CYP2C9 и CYP4F2 ассоциированы с изменением функциональной активности ферментов, что влияет на скорость выведения варфарина из организма и, соответственно, на индивидуальную чувствительность к антикоагулянтной терапии.

VKORC1 – это субъединица 1 комплекса эпоксидредуктаза-витамин К, ключевого фермента цикла витамина К. Варфарин ингибирует этот фермент, реализуя таким образом антикоагулянтный эффект за счет ингибирования процесса активации факторов свертывания.

Для расчета индивидуальной дозы варфарина разработаны специальные алгоритмы, наиболее известный находится на сайте WarfarinDosing.org. Они основаны на оценке как клинических (возраст, пол, национальность пациента, образ жизни (курение), наличие или отсутствие заболеваний печени, текущее и целевое МНО, прием лекарств, модулирующих действие варфарина и т.д.), так и генетических факторов (генотипы CYP29C, CYP4F2,

VKORC1 и т.д.).

Полиморфизмы CYP2C9 Arg144Cys (rs1799853) и lle359Leu (rs1057910) рекомендуется тестировать перед назначением таких лекарственных средств, как warfarin, phenytoin, acenocoumarol, glibenclamide, gliclazide, glimepiride, phenprocoumon, tolbutamide.

Полиморфизм Val433Met (rs2108622) в гене CYP4F2 рекомендуется тестировать перед назначением таких лекарственных средств, как warfarin, phenprocoumon, acenocoumarol, Vitamin E. А также в качестве маркёра повышенного риска развития ишемического инсульта.

Полиморфизм -1639 G>A (rs9923231) в гене VKORC1 рекомендуется тестировать перед назначением таких лекарственных средств, как warfarin, phenprocoumon, acenocoumarol. А также в качестве маркёра повышенного риска развития ишемического инсульта.

Тестируются следующие 4 ОНП: ген ABCB1 3435 C>T; ген CYP2C19 681 G>A*2 (P227P); 636 G>A*3 (W212X); -806 C>T *17.

Полиморфизмы в гене CYP2C19 рекомендуется тестировать перед назначением таких лекарственных средств, как clopidogrel, voriconazole, omeprazole, esomeprazole, lansoprazole, rabeprazole, pantoprazole, doxepin, amitriptyline, clomipramine, imipramine, trimipramine, sertraline, citalopram, escitalopram, moclobemide.

Полиморфизм 3435 C>T в гене ABCB1 рекомендуется тестировать перед назначением таких лекарственных средств, как clopidogrel, digoxin, aliskiren, nevirapine, fentanyl methotrexate, methadone, morphine, opioids, oxycodone, tramadol, ondansetron, atazanavir, atorvastatin, phenytoin, ondansetron, dexamethasone, tacrolimus, verapamil, talinolol, carbamazepine, losartan. Информация доступна на сайте https://www.pharmgkb.org/.

В настоящее время точно установлено, что изменения в кластере генов цитокинов (IL28A, IL28B и IL29), локализованных на 19 хромосоме (19q13) человека являются основным фактором, определяющим особенности противовирусной защиты организма. Наибольшее значение имеет полиморфизм в регионе, примыкающем к гену интерлейкина 28B (IL28B) [Ge D., 2009]. Показано, что полиморфизмы IL28B определяют как вероятность самопроизвольной элиминации HCV, так и ответ на терапию интерфероном и рибавирином. Основную роль при инфицировании гепатитом С играют две однонуклеотидные замены:

• замена цитозина на тимин (C>T), имеющая обозначение rs12979860 в базе данных dbSNP национального центра биотехнологической информации США (National Center for Biotechnological Information, NCBI).

• замена тимина на гуанин (T>G), имеющая обозначение rs8099917

У носителей генотипа rs12979860 С/С наблюдается повышение в два раза вероятности положительного ответа на лечение интерфероном и рибавирином. Также генотип С/С преимущественно выявляется среди людей со спонтанным разрешением инфекции, иммунная система носителей аллелей С/С более склонна самостоятельно побеждать вирус. Интересно, что при генотипе С/С вирусная нагрузка (количество вируса в крови) до лечения выше, чем у носителей аллелей Т/Т [Kempuraj D. at all, 2004].

Генотип rs8099917 Т/Т связан со спонтанным разрешением инфекции, независимо от лечения [Grebely J. at all, 2010]. Аллель G в rs8099917 является аллелем риска, и ассоциирован с низким уровнем ответа на терапию пегилированным интерфероном и рибавирином [Grebely J. at 2009, Rauch A. at all, 2010].

Исследования по изучению роли генетического полиморфизма указанных регионов человеческого генома показали, что положительное предсказательное значение полиморфизма IL28B выше, чем других базовых характеристик – предикторов успеха терапии (индекса массы тела, возраста, стадии фиброза и вирусной нагрузки) [Stattermayer A. F. at all, 2008]. Более подробная информация по алгоритму ведения больных с хроническим гепатитом С и интерпретация результатов тестирования ОНП в IL28B.pdf

1. Ген CTLA4 (49 A/G)

2. Ген PTPN22 (C1858T).

1. Определение VNTR полиморфизма в гене дофаминового рецептора DRD4. Носительство 5 и более VNTR повторов ассоциировано с предрасположенностью к развитию никотиновой, алкогольной и наркотической зависимости (и других аддикций), синдрома дефицита внимания с гиперактивностью.

2. Определение VNTR полиморфизма в гене дофаминового транспортёра DAT (SLC6A3). Носительство 9 VNTR повторов ассоциировано с предрасположенностью к развитию никотиновой, алкогольной и наркотической зависимости (и других аддикций), синдрома дефицита внимания с гиперактивностью.

3. Определение ID и VNTR полиморфизмов в гене серотонинового транспортера SERT (5-HTT или SLC6A4). Эти полиморфизмы ассоциированы с некоторыми расстройствами психики и ответом на применяемые для их лечения лекарственные препараты.

Кровь для анализа забирается в пробирку/вакутейнер с ЭДТА (4-10 мл), который переворачивается несколько раз для перемешивания, разборчиво подписывается и помещается в холодильник.

Если планируется хранение крови до анализа более 3-х суток – она замораживается и хранится в морозильной камере.

НИИТПМ - филиал ИЦиГ СО РАН, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова 175/1

проезд до станции метро "Золотая нива" или остановки "Молодёжная" или до остановки "Кошурникова".

тел. 2679755, сайт: www.iimed.ru,

Сдать кровь на анализ (из вены) можно с понедельника по пятницу

9.00-10.30 (независимо от приёма пищи).